论著
miR-497抑制结肠癌细胞HCT116炎症相关基因表达的基因芯片研究
肿瘤研究与临床, 2017,29(1) : 1-6. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1006-9801.2017.01.001
摘要
目的

采用基因芯片分析miR-497高表达对结肠癌细胞HCT116基因表达谱的影响。

方法

利用慢病毒感染人结肠癌细胞株HCT116,建立miR-497稳定高表达的结肠癌细胞模型HCT116-497细胞及阴性对照HCT116-CON细胞,用全基因组表达谱芯片筛选差异表达基因,利用MAS 3.0生物信息注释系统进行基因本体(gene ontology,GO)和信号通路富集分析(pathway analysis),筛选炎症相关基因。应用实时定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)对候选基因进行验证。

结果

筛选出绝对倍数变化(absolute fold change)3.0倍以上的下调基因582个,发现其主要富集于炎症相关细胞因子网络等信号通路。选取下调基因中参与细胞因子网络和MAPK信号通路的15个炎症相关基因进行PCR验证后显示,与HCT116-CON细胞相比,HCT116-497细胞中10个基因(CACNB1、FOS、IL-29、RPS6KA2、TNFSF15、IL-11、INHBC、CSF1R、JAK3和IL-2Rβ)表达水平降低,差异均有统计学意义(均P<0.05),与芯片结果一致。

结论

miR-497抑制结肠癌细胞HCT116中炎症相关基因mRNA的表达。

引用本文: 王娟娟, 杨瑞红, 王福花, 等.  miR-497抑制结肠癌细胞HCT116炎症相关基因表达的基因芯片研究 [J]. 肿瘤研究与临床,2017,29( 1 ): 1-6. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1006-9801.2017.01.001
正文
作者信息
基金 0  关键词  0
English Abstract
评论
阅读 0  评论  0
相关资源
论文 | 视频

版权归中华医学会所有。

未经授权,不得转载、摘编本刊文章,不得使用本刊的版式设计。

除非特别声明,本刊刊出的所有文章不代表中华医学会和本刊编委会的观点。

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是人类主要恶性肿瘤之一,大多数CRC的发生与环境和非遗传因素有关,其中慢性炎症是CRC发生发展的重要危险因素之一。越来越多的证据表明,许多微RNA(miRNA)可以调控炎症相关因子的表达,促进或抑制炎症相关肿瘤的发生[1]。miR-497位于17号染色体短臂13.1(17p13.1),属于miR-15/16/195/424/497家族成员。miR-497参与调节细胞周期、缺氧应激、血管通透性、DNA损伤修复、细胞凋亡等一系列过程[2,3,4,5]。近年来研究发现,miR-497表达下调与CRC、乳腺癌、黑色素瘤、肾上腺皮质癌、头颈部鳞状细胞癌等多种肿瘤发生关系密切,因此被视作一个肿瘤抑制基因[2,3]。我们的前期工作也证实在结肠癌组织和结肠癌细胞系中miR-497低表达,并且发现miR-497能够抑制结肠癌细胞的增殖和侵袭能力,促进凋亡发生[6]。研究表明,结肠癌引发的炎症反应可以促进肿瘤的发展和转移[7]。为了确定miR-497高表达对结肠癌细胞基因表达谱的影响,探索miR-497是否参与结肠癌相关炎症反应,我们建立了miR-497稳定高表达的结肠癌细胞株,利用人基因组表达谱芯片筛选差异表达基因,结合生物信息学方法对差异基因进行基因本体(gene ontology,GO)和信号通路富集分析(pathway analysis),筛选可能受miR-497调控的炎症相关基因,为下一步研究miR-497调控结肠癌炎症反应的机制及其效应奠定基础。

 
 
展开/关闭提纲
查看图表详情
回到顶部
放大字体
缩小字体
标签
关键词
炎症相关基因
信号通路富集分析
miR-497
基因本体
结肠肿瘤