论著
应用微阵列芯片初步分析胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱
肿瘤研究与临床, 2015,27(5) : 310-315. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1006-9801.2015.05.005
摘要
目的

应用微阵列芯片技术研究胃癌与癌旁正常组织miRNA差异表达谱,探讨miRNA与胃癌的发病关系。

方法

提取5例胃癌患者癌组织及其对应癌旁正常组织中的miRNA,分别与哺乳动物miRNA芯片V3.0杂交,扫描荧光信号,对癌组织、癌旁正常组织进行差异基因筛选和聚类分析。采用实时定量PCR Taqman荧光探针法验证差异表达的hsa-miR-30c、hsa-miR-196a、hsa-miR-193b。利用在线靶基因预测软件对hsa-miR-30c的靶基因预测。

结果

miRNA表达谱微阵列芯片筛选出显著差异表达的miRNA共16个,胃癌组织与癌旁正常组织比较,miRNA表达水平上调超过两倍且差异有统计学意义(P<0.05)的有5个,分别是HS_100、hsa-miR-27a、hsa-miR-214*、solexa-555-1991、hsa-miR-196,表达水平下调超过两倍且差异有统计学意义(P<0.05)的有11个,分别是hsa-miR-502-3p、hsa-miR-29c*、hsa-miR-64、hsa-miR-193b、hsa-miR-551b、hsa-miR-30c、hsa-miR-582-5p、hsa-miR-625*、hsa-miR-660、hsa-miR-363、hsa-miR-486-5p。荧光定量PCR验证hsa-miR-30c, hsa-miR-196a和hsa-miR-193b表达与miRNA芯片的结果相符合。

结论

胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱中的miRNA可能参与胃癌发生的调控,并将成为潜在的胃癌标志物。

引用本文: 牟永平, 韩汶延, 苏秀兰. 应用微阵列芯片初步分析胃癌与癌旁组织miRNA差异表达谱 [J]. 肿瘤研究与临床,2015,27( 5 ): 310-315. DOI: 10.3760/cma.j.issn.1006-9801.2015.05.005
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胃癌是最常见的恶性肿瘤之一,我国胃癌发病大约占全世界的42 %[1]。根治性手术依然是提高患者长期生存的有效手段,但5年生存率仍然低于20 %[2]。胃癌的发病机制还没有完全阐释清楚。胃癌的发生是包括多基因、多步骤、基因与环境相互作用的致病过程[3]。目前在中国胃癌依然是一项沉重的负担[4],采取有效的防治策略显得尤为重要。因此,采用特异的早期诊断标志物来提高患者的生存意义重大。miRNA是一类微小的内源性非编码RNA,在转录后水平以负向调节的方式调控基因的表达[5]。miRNA的5'末端2~8位置的核酸作为种子序列可与靶标转录本的3'非转录区域结合发挥潜在的癌基因或抑癌基因的功能[6]。Calin等[7]证实超过约50%的miRNA定位于与肿瘤相关的基因组区域或者是脆性位点,提示miRNA在肿瘤发生中扮演重要的角色。miRNA具有高度的保守性、时序性和组织特异性,对细胞增殖、分化、凋亡以及维持内环境的稳态,尤其在肿瘤发生和发展中发挥重要作用[8]。目前miRNA芯片技术以其高通量、迅速、操作简便的特点已越来越多地被应用于肿瘤研究中。已有研究表明,许多肿瘤有其特异性的miRNA表达谱,miRNA的异常表达与肿瘤的发生和发展及病理分期、预后和治疗相关[8,9]。为了研究miRNA与胃癌的关系,本研究应用miRNA芯片技术检测了5例胃癌患者癌和癌旁配对正常组织的miRNA表达谱,分析两者间的差异miRNA,为进一步研究胃癌发生和发展机制以及发现胃癌诊断和治疗相关的分子标志物奠定基础。

 
 
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微小RNA
芯片
胃肿瘤
表达谱